Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS9

Stkld1, Serine/threonine kinase-like domain-containing protein STKLD1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stkld1Q80YS9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stkld1Q80YS9 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms