Protein–RNA interactions for Protein: Q80XC6

Nrde2, Protein NRDE2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrde2Q80XC6 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms