Protein–RNA interactions for Protein: Q80UW8

Polr2e, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2eQ80UW8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2eQ80UW8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms