Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms