Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
NischQ80TM9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC31.95■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC31.94■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
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