Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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Clec18aQ7TSQ1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Clec18aQ7TSQ1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clec18aQ7TSQ1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clec18aQ7TSQ1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clec18aQ7TSQ1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec18aQ7TSQ1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec18aQ7TSQ1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec18aQ7TSQ1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec18aQ7TSQ1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Clec18aQ7TSQ1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec18aQ7TSQ1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec18aQ7TSQ1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec18aQ7TSQ1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Clec18aQ7TSQ1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec18aQ7TSQ1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec18aQ7TSQ1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec18aQ7TSQ1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Clec18aQ7TSQ1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec18aQ7TSQ1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec18aQ7TSQ1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec18aQ7TSQ1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec18aQ7TSQ1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec18aQ7TSQ1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec18aQ7TSQ1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec18aQ7TSQ1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec18aQ7TSQ1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec18aQ7TSQ1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec18aQ7TSQ1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec18aQ7TSQ1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec18aQ7TSQ1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec18aQ7TSQ1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec18aQ7TSQ1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Clec18aQ7TSQ1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Clec18aQ7TSQ1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec18aQ7TSQ1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec18aQ7TSQ1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec18aQ7TSQ1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec18aQ7TSQ1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec18aQ7TSQ1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec18aQ7TSQ1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec18aQ7TSQ1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec18aQ7TSQ1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec18aQ7TSQ1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec18aQ7TSQ1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec18aQ7TSQ1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec18aQ7TSQ1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec18aQ7TSQ1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec18aQ7TSQ1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec18aQ7TSQ1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec18aQ7TSQ1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec18aQ7TSQ1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec18aQ7TSQ1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec18aQ7TSQ1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec18aQ7TSQ1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec18aQ7TSQ1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec18aQ7TSQ1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec18aQ7TSQ1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec18aQ7TSQ1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec18aQ7TSQ1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Clec18aQ7TSQ1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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