Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH2

Phkb, Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PhkbQ7TSH2 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PhkbQ7TSH2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms