Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctdp1Q7TSG2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms