Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ckap2lQ7TS74 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.1 ms