Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms