Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf139Q7TMV1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf139Q7TMV1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf139Q7TMV1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf139Q7TMV1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf139Q7TMV1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf139Q7TMV1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf139Q7TMV1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf139Q7TMV1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf139Q7TMV1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf139Q7TMV1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf139Q7TMV1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf139Q7TMV1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf139Q7TMV1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf139Q7TMV1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf139Q7TMV1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf139Q7TMV1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf139Q7TMV1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf139Q7TMV1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf139Q7TMV1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf139Q7TMV1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf139Q7TMV1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf139Q7TMV1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf139Q7TMV1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf139Q7TMV1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf139Q7TMV1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf139Q7TMV1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf139Q7TMV1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf139Q7TMV1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf139Q7TMV1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf139Q7TMV1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf139Q7TMV1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf139Q7TMV1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf139Q7TMV1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf139Q7TMV1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf139Q7TMV1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf139Q7TMV1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf139Q7TMV1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf139Q7TMV1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf139Q7TMV1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf139Q7TMV1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf139Q7TMV1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf139Q7TMV1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf139Q7TMV1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf139Q7TMV1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf139Q7TMV1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf139Q7TMV1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf139Q7TMV1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf139Q7TMV1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms