Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms