Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ubfd1Q78JW9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubfd1Q78JW9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubfd1Q78JW9 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ubfd1Q78JW9 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubfd1Q78JW9 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubfd1Q78JW9 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ubfd1Q78JW9 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ubfd1Q78JW9 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ubfd1Q78JW9 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ubfd1Q78JW9 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ubfd1Q78JW9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubfd1Q78JW9 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubfd1Q78JW9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ubfd1Q78JW9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ubfd1Q78JW9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubfd1Q78JW9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubfd1Q78JW9 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ubfd1Q78JW9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubfd1Q78JW9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms