Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nme8Q715T0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms