Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SynmQ70IV5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SynmQ70IV5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms