Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Prrg2-211ENSMUST00000211337 676 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms