Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ino80Q6ZPV2 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ino80Q6ZPV2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms