Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAR7

Ssxb10, MCG68110, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb10Q6XAR7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssxb10Q6XAR7 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssxb10Q6XAR7 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssxb10Q6XAR7 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssxb10Q6XAR7 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssxb10Q6XAR7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssxb10Q6XAR7 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssxb10Q6XAR7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssxb10Q6XAR7 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssxb10Q6XAR7 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssxb10Q6XAR7 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssxb10Q6XAR7 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssxb10Q6XAR7 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssxb10Q6XAR7 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssxb10Q6XAR7 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssxb10Q6XAR7 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssxb10Q6XAR7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssxb10Q6XAR7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssxb10Q6XAR7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssxb10Q6XAR7 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssxb10Q6XAR7 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssxb10Q6XAR7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssxb10Q6XAR7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssxb10Q6XAR7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssxb10Q6XAR7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssxb10Q6XAR7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssxb10Q6XAR7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssxb10Q6XAR7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssxb10Q6XAR7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssxb10Q6XAR7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssxb10Q6XAR7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssxb10Q6XAR7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssxb10Q6XAR7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssxb10Q6XAR7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssxb10Q6XAR7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssxb10Q6XAR7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssxb10Q6XAR7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Ssxb10Q6XAR7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssxb10Q6XAR7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssxb10Q6XAR7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssxb10Q6XAR7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssxb10Q6XAR7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Ssxb10Q6XAR7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Ssxb10Q6XAR7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssxb10Q6XAR7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssxb10Q6XAR7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssxb10Q6XAR7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Ssxb10Q6XAR7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssxb10Q6XAR7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
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Ssxb10Q6XAR7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssxb10Q6XAR7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Ssxb10Q6XAR7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Ssxb10Q6XAR7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssxb10Q6XAR7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssxb10Q6XAR7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Ssxb10Q6XAR7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssxb10Q6XAR7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssxb10Q6XAR7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Ssxb10Q6XAR7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssxb10Q6XAR7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Ssxb10Q6XAR7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssxb10Q6XAR7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssxb10Q6XAR7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssxb10Q6XAR7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssxb10Q6XAR7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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