Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms