Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms