Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97 ms