Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad54bQ6PFE3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms