Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Vstm2lQ6PDS0 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Vstm2lQ6PDS0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vstm2lQ6PDS0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vstm2lQ6PDS0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vstm2lQ6PDS0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vstm2lQ6PDS0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vstm2lQ6PDS0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vstm2lQ6PDS0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vstm2lQ6PDS0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vstm2lQ6PDS0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vstm2lQ6PDS0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vstm2lQ6PDS0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vstm2lQ6PDS0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vstm2lQ6PDS0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vstm2lQ6PDS0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vstm2lQ6PDS0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vstm2lQ6PDS0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vstm2lQ6PDS0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vstm2lQ6PDS0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vstm2lQ6PDS0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vstm2lQ6PDS0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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