Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK0

Zbtb39, Zinc finger and BTB domain-containing 39, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb39Q6PDK0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbtb39Q6PDK0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zbtb39Q6PDK0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zbtb39Q6PDK0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zbtb39Q6PDK0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zbtb39Q6PDK0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zbtb39Q6PDK0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zbtb39Q6PDK0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zbtb39Q6PDK0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbtb39Q6PDK0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbtb39Q6PDK0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbtb39Q6PDK0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbtb39Q6PDK0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbtb39Q6PDK0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbtb39Q6PDK0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbtb39Q6PDK0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbtb39Q6PDK0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbtb39Q6PDK0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbtb39Q6PDK0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbtb39Q6PDK0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms