Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Gapvd1Q6PAR5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gapvd1Q6PAR5 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms