Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc148Q6P5U8 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc148Q6P5U8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc148Q6P5U8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc148Q6P5U8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc148Q6P5U8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc148Q6P5U8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc148Q6P5U8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc148Q6P5U8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc148Q6P5U8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms