Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5G6

Ubxn7, UBX domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn7Q6P5G6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn7Q6P5G6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn7Q6P5G6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn7Q6P5G6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn7Q6P5G6 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn7Q6P5G6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn7Q6P5G6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn7Q6P5G6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubxn7Q6P5G6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn7Q6P5G6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn7Q6P5G6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn7Q6P5G6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn7Q6P5G6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn7Q6P5G6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn7Q6P5G6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn7Q6P5G6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn7Q6P5G6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn7Q6P5G6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn7Q6P5G6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn7Q6P5G6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn7Q6P5G6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn7Q6P5G6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn7Q6P5G6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn7Q6P5G6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn7Q6P5G6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn7Q6P5G6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn7Q6P5G6 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn7Q6P5G6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn7Q6P5G6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn7Q6P5G6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn7Q6P5G6 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn7Q6P5G6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn7Q6P5G6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn7Q6P5G6 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn7Q6P5G6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn7Q6P5G6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn7Q6P5G6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn7Q6P5G6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn7Q6P5G6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn7Q6P5G6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn7Q6P5G6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn7Q6P5G6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn7Q6P5G6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn7Q6P5G6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ubxn7Q6P5G6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ubxn7Q6P5G6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Ubxn7Q6P5G6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ubxn7Q6P5G6 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ubxn7Q6P5G6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn7Q6P5G6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn7Q6P5G6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn7Q6P5G6 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn7Q6P5G6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn7Q6P5G6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn7Q6P5G6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn7Q6P5G6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn7Q6P5G6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn7Q6P5G6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn7Q6P5G6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn7Q6P5G6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn7Q6P5G6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn7Q6P5G6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn7Q6P5G6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn7Q6P5G6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn7Q6P5G6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn7Q6P5G6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn7Q6P5G6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn7Q6P5G6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn7Q6P5G6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn7Q6P5G6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn7Q6P5G6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn7Q6P5G6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn7Q6P5G6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn7Q6P5G6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn7Q6P5G6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn7Q6P5G6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn7Q6P5G6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn7Q6P5G6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn7Q6P5G6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn7Q6P5G6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn7Q6P5G6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn7Q6P5G6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn7Q6P5G6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn7Q6P5G6 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn7Q6P5G6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn7Q6P5G6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn7Q6P5G6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn7Q6P5G6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn7Q6P5G6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn7Q6P5G6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn7Q6P5G6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn7Q6P5G6 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn7Q6P5G6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn7Q6P5G6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn7Q6P5G6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn7Q6P5G6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn7Q6P5G6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn7Q6P5G6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn7Q6P5G6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn7Q6P5G6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms