Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg2aQ6P4T0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms