Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L7

Casc4, Protein CASC4, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc4Q6P2L7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casc4Q6P2L7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Casc4Q6P2L7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Casc4Q6P2L7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Casc4Q6P2L7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms