Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Y1

Rtl3, Retrotransposon Gag-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl3Q6P1Y1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms