Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Slx4Q6P1D7 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms