Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gpbp1Q6NXH3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms