Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SphkapQ6NSW3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SphkapQ6NSW3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms