Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms