Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX2

Krt42, Keratin, type I cytoskeletal 42, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt42Q6IFX2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt42Q6IFX2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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