Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg9bQ6EBV9 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms