Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW5

Atp11b, Phospholipid-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11bQ6DFW5 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp11bQ6DFW5 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp11bQ6DFW5 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp11bQ6DFW5 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp11bQ6DFW5 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp11bQ6DFW5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp11bQ6DFW5 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp11bQ6DFW5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp11bQ6DFW5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms