Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Cep290Q6A078 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Cep290Q6A078 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Cep290Q6A078 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Cep290Q6A078 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Cep290Q6A078 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
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Cep290Q6A078 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Cep290Q6A078 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Cep290Q6A078 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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