Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms