Protein–RNA interactions for Protein: Q64518

Atp2a3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a3Q64518 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms