Protein–RNA interactions for Protein: Q64512

Ptpn13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn13Q64512 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Ptpn13Q64512 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Ptpn13Q64512 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Ptpn13Q64512 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Ptpn13Q64512 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
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Ptpn13Q64512 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn13Q64512 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms