Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf4Q64287 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms