Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Defa17Q64016 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Defa17Q64016 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Defa17Q64016 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Defa17Q64016 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Defa17Q64016 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Defa17Q64016 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms