Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms