Protein–RNA interactions for Protein: Q62513

Znf260, Zinc finger protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf260Q62513 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf260Q62513 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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