Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CochQ62507 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CochQ62507 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CochQ62507 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CochQ62507 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CochQ62507 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CochQ62507 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CochQ62507 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CochQ62507 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CochQ62507 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CochQ62507 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CochQ62507 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CochQ62507 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CochQ62507 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CochQ62507 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CochQ62507 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CochQ62507 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CochQ62507 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CochQ62507 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CochQ62507 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CochQ62507 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CochQ62507 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CochQ62507 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CochQ62507 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CochQ62507 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CochQ62507 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CochQ62507 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CochQ62507 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CochQ62507 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CochQ62507 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CochQ62507 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CochQ62507 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CochQ62507 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CochQ62507 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CochQ62507 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CochQ62507 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CochQ62507 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CochQ62507 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CochQ62507 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CochQ62507 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CochQ62507 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CochQ62507 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CochQ62507 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CochQ62507 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CochQ62507 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CochQ62507 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CochQ62507 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CochQ62507 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CochQ62507 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CochQ62507 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CochQ62507 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CochQ62507 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CochQ62507 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CochQ62507 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CochQ62507 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CochQ62507 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CochQ62507 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CochQ62507 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CochQ62507 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CochQ62507 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CochQ62507 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CochQ62507 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CochQ62507 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CochQ62507 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CochQ62507 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CochQ62507 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CochQ62507 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CochQ62507 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CochQ62507 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CochQ62507 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CochQ62507 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CochQ62507 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CochQ62507 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CochQ62507 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CochQ62507 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CochQ62507 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CochQ62507 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CochQ62507 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CochQ62507 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CochQ62507 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CochQ62507 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CochQ62507 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CochQ62507 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CochQ62507 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CochQ62507 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CochQ62507 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CochQ62507 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CochQ62507 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CochQ62507 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CochQ62507 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CochQ62507 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CochQ62507 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CochQ62507 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CochQ62507 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CochQ62507 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CochQ62507 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CochQ62507 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CochQ62507 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CochQ62507 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CochQ62507 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms