Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CcncQ62447 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcncQ62447 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcncQ62447 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CcncQ62447 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcncQ62447 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcncQ62447 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcncQ62447 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcncQ62447 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcncQ62447 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms