Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa13Q62424 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms