Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Supt6hQ62383 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Supt6hQ62383 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Supt6hQ62383 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Supt6hQ62383 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Supt6hQ62383 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Supt6hQ62383 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Supt6hQ62383 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Supt6hQ62383 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Supt6hQ62383 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Supt6hQ62383 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Supt6hQ62383 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Supt6hQ62383 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Supt6hQ62383 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Supt6hQ62383 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Supt6hQ62383 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Supt6hQ62383 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Supt6hQ62383 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Supt6hQ62383 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Supt6hQ62383 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Supt6hQ62383 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Supt6hQ62383 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Supt6hQ62383 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Supt6hQ62383 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Supt6hQ62383 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Supt6hQ62383 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Supt6hQ62383 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Supt6hQ62383 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Supt6hQ62383 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Supt6hQ62383 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Supt6hQ62383 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Supt6hQ62383 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Supt6hQ62383 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Supt6hQ62383 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Supt6hQ62383 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Supt6hQ62383 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Supt6hQ62383 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Supt6hQ62383 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Supt6hQ62383 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Supt6hQ62383 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Supt6hQ62383 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Supt6hQ62383 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Supt6hQ62383 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Supt6hQ62383 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Supt6hQ62383 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Supt6hQ62383 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Supt6hQ62383 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Supt6hQ62383 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Supt6hQ62383 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Supt6hQ62383 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Supt6hQ62383 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Supt6hQ62383 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Supt6hQ62383 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Supt6hQ62383 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Supt6hQ62383 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms