Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Ss18Q62280 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Ss18Q62280 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Ss18Q62280 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Ss18Q62280 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Ss18Q62280 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Ss18Q62280 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Ss18Q62280 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Ss18Q62280 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ss18Q62280 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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